Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP31Q70CQ4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
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