Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNE3Q6ZMZ3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNE3Q6ZMZ3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNE3Q6ZMZ3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNE3Q6ZMZ3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNE3Q6ZMZ3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNE3Q6ZMZ3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNE3Q6ZMZ3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNE3Q6ZMZ3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNE3Q6ZMZ3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNE3Q6ZMZ3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNE3Q6ZMZ3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNE3Q6ZMZ3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNE3Q6ZMZ3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNE3Q6ZMZ3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNE3Q6ZMZ3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNE3Q6ZMZ3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNE3Q6ZMZ3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNE3Q6ZMZ3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNE3Q6ZMZ3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNE3Q6ZMZ3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNE3Q6ZMZ3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNE3Q6ZMZ3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNE3Q6ZMZ3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNE3Q6ZMZ3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNE3Q6ZMZ3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNE3Q6ZMZ3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNE3Q6ZMZ3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNE3Q6ZMZ3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNE3Q6ZMZ3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNE3Q6ZMZ3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNE3Q6ZMZ3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNE3Q6ZMZ3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNE3Q6ZMZ3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNE3Q6ZMZ3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNE3Q6ZMZ3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNE3Q6ZMZ3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNE3Q6ZMZ3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNE3Q6ZMZ3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNE3Q6ZMZ3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms