Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM72Q6ZMU5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM72Q6ZMU5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM72Q6ZMU5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM72Q6ZMU5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM72Q6ZMU5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM72Q6ZMU5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM72Q6ZMU5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM72Q6ZMU5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM72Q6ZMU5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM72Q6ZMU5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM72Q6ZMU5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM72Q6ZMU5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM72Q6ZMU5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM72Q6ZMU5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM72Q6ZMU5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM72Q6ZMU5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM72Q6ZMU5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM72Q6ZMU5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM72Q6ZMU5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM72Q6ZMU5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM72Q6ZMU5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM72Q6ZMU5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM72Q6ZMU5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM72Q6ZMU5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM72Q6ZMU5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM72Q6ZMU5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM72Q6ZMU5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM72Q6ZMU5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM72Q6ZMU5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM72Q6ZMU5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM72Q6ZMU5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM72Q6ZMU5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM72Q6ZMU5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM72Q6ZMU5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM72Q6ZMU5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM72Q6ZMU5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM72Q6ZMU5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM72Q6ZMU5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM72Q6ZMU5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM72Q6ZMU5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms