Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms