Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVM6

CCDC30, Coiled-coil domain-containing protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC30Q5VVM6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC30Q5VVM6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms