Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf53Q5VUE5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms