Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf135Q5VTT2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms