Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AGAP9Q5VTM2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AGAP9Q5VTM2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AGAP9Q5VTM2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
AGAP9Q5VTM2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AGAP9Q5VTM2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AGAP9Q5VTM2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AGAP9Q5VTM2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AGAP9Q5VTM2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
AGAP9Q5VTM2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AGAP9Q5VTM2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AGAP9Q5VTM2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms