Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDGFL1Q5TGJ6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms