Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAMD5Q5TGI4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms