Protein–RNA interactions for Protein: Q5TAH2

SLC9C2, Sodium/hydrogen exchanger 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9C2Q5TAH2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC9C2Q5TAH2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC9C2Q5TAH2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC9C2Q5TAH2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC9C2Q5TAH2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC9C2Q5TAH2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC9C2Q5TAH2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC9C2Q5TAH2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC9C2Q5TAH2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC9C2Q5TAH2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC9C2Q5TAH2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC9C2Q5TAH2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC9C2Q5TAH2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC9C2Q5TAH2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC9C2Q5TAH2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC9C2Q5TAH2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC9C2Q5TAH2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC9C2Q5TAH2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC9C2Q5TAH2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC9C2Q5TAH2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC9C2Q5TAH2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms