Protein–RNA interactions for Protein: Q5T447

HECTD3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD3Q5T447 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HECTD3Q5T447 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HECTD3Q5T447 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms