Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf220Q5T0J3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf220Q5T0J3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms