Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC32.24■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
FRMPD1Q5SYB0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FRMPD1Q5SYB0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms