Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms