Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LDLRAP1Q5SW96 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms