Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CEP78Q5JTW2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CEP78Q5JTW2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CEP78Q5JTW2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CEP78Q5JTW2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CEP78Q5JTW2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP78Q5JTW2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms