Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB6CQ53S08 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms