Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GREB1Q4ZG55 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms