Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms