Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT71Q3SY84 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT71Q3SY84 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms