Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC57Q2TAC2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC57Q2TAC2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC57Q2TAC2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC57Q2TAC2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC57Q2TAC2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC57Q2TAC2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC57Q2TAC2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC57Q2TAC2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC57Q2TAC2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC57Q2TAC2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC57Q2TAC2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC57Q2TAC2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC57Q2TAC2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC57Q2TAC2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC57Q2TAC2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC57Q2TAC2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC57Q2TAC2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC57Q2TAC2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC57Q2TAC2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC57Q2TAC2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC57Q2TAC2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC57Q2TAC2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC57Q2TAC2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC57Q2TAC2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC57Q2TAC2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC57Q2TAC2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC57Q2TAC2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC57Q2TAC2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC57Q2TAC2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC57Q2TAC2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms