Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERCC6LQ2NKX8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms