Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSPP1Q1MSJ5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
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