Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
IMPG1Q17R60 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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