Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDUFA9Q16795 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms