Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF239Q16600 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF239Q16600 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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