Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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