Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF4Q15306 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF4Q15306 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF4Q15306 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF4Q15306 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF4Q15306 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF4Q15306 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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