Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
LAPTM4AQ15012 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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