Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NFIXQ14938 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
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