Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMCO1Q147U7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMCO1Q147U7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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