Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSPNQ14714 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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