Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRP1BQ14684 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP1BQ14684 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms