Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2H2Q13888 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2H2Q13888 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms