Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNA1SQ13698 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNA1SQ13698 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
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