Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CUL4BQ13620 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CUL4BQ13620 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CUL4BQ13620 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
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