Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUL1Q13616 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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