Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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