Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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C1orf61Q13536 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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C1orf61Q13536 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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C1orf61Q13536 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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C1orf61Q13536 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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C1orf61Q13536 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
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C1orf61Q13536 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C1orf61Q13536 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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C1orf61Q13536 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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