Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PICALMQ13492 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms