Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB3BPQ13352 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms