Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGCGQ13326 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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SGCGQ13326 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGCGQ13326 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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