Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.751e-10■■■■■ 27.3
PABPC4Q13310 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.568e-9■■■■■ 27.3
PABPC4Q13310 ARHGAP4-224ENST00000494813 1939 ntTSL 523.81■■□□□ 1.48e-9■■■■■ 27.3
PABPC4Q13310 NAA10-209ENST00000466877 1080 ntTSL 1 (best)21.06■□□□□ 0.968e-9■■■■■ 27.3
PABPC4Q13310 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.628e-9■■■■■ 27.3
PABPC4Q13310 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.628e-9■■■■■ 27.3
PABPC4Q13310 NAA10-205ENST00000393712 908 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.058e-9■■■■■ 27.3
PABPC4Q13310 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.467e-9■■■■■ 27.3
PABPC4Q13310 ACAT1-210ENST00000533597 558 ntTSL 27.09□□□□□ -1.277e-9■■■■■ 27.3
PABPC4Q13310 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.064e-11■■■■■ 27.3
PABPC4Q13310 BUB3-203ENST00000368865 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.934e-11■■■■■ 27.3
PABPC4Q13310 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.134e-9■■■■■ 27.3
PABPC4Q13310 PET100-204ENST00000600836 474 ntTSL 316.35■□□□□ 0.211e-6■■■■■ 27.3
PABPC4Q13310 RPL13-213ENST00000565571 568 ntTSL 217.37■□□□□ 0.372e-46■■■■■ 27.3
PABPC4Q13310 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.419e-13■■■■■ 27.3
PABPC4Q13310 SETD2-201ENST00000330022 8172 ntTSL 1 (best)6.02□□□□□ -1.459e-13■■■■■ 27.3
PABPC4Q13310 SETD2-204ENST00000431180 7555 ntTSL 25.86□□□□□ -1.479e-13■■■■■ 27.3
PABPC4Q13310 SETD2-205ENST00000445387 7075 ntTSL 54.76□□□□□ -1.659e-13■■■■■ 27.3
PABPC4Q13310 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.081e-6■■■■■ 27.3
PABPC4Q13310 PDZD11-202ENST00000374454 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.541e-6■■■■■ 27.3
PABPC4Q13310 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.56e-9■■■■■ 27.3
PABPC4Q13310 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.346e-9■■■■■ 27.3
PABPC4Q13310 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.296e-9■■■■■ 27.3
PABPC4Q13310 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.226e-9■■■■■ 27.3
PABPC4Q13310 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.196e-9■■■■■ 27.3
PABPC4Q13310 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.166e-9■■■■■ 27.3
PABPC4Q13310 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.166e-9■■■■■ 27.3
PABPC4Q13310 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.146e-9■■■■■ 27.3
PABPC4Q13310 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.066e-9■■■■■ 27.3
PABPC4Q13310 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.026e-9■■■■■ 27.3
PABPC4Q13310 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.773e-17■■■■■ 27.3
PABPC4Q13310 ZMYND8-212ENST00000458360 3729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.943e-8■■■■■ 27.2
PABPC4Q13310 NOP53-204ENST00000595143 810 ntTSL 524.27■■□□□ 1.489e-8■■■■■ 27.2
PABPC4Q13310 NOP53-205ENST00000597985 656 ntTSL 318.37■□□□□ 0.539e-8■■■■■ 27.2
PABPC4Q13310 NOP53-208ENST00000598959 501 ntTSL 512.84□□□□□ -0.359e-8■■■■■ 27.2
PABPC4Q13310 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.142e-7■■■■■ 27.2
PABPC4Q13310 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.12e-7■■■■■ 27.2
PABPC4Q13310 RPS15A-209ENST00000573554 606 ntTSL 1 (best)20.28■□□□□ 0.841e-323■■■■■ 27.2
PABPC4Q13310 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.366e-17■■■■■ 27.2
PABPC4Q13310 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.96e-17■■■■■ 27.2
PABPC4Q13310 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.836e-17■■■■■ 27.2
PABPC4Q13310 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.636e-17■■■■■ 27.2
PABPC4Q13310 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.636e-17■■■■■ 27.2
PABPC4Q13310 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.556e-17■■■■■ 27.2
PABPC4Q13310 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.786e-17■■■■■ 27.2
PABPC4Q13310 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.66e-17■■■■■ 27.2
PABPC4Q13310 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.326e-17■■■■■ 27.2
PABPC4Q13310 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.076e-17■■■■■ 27.2
PABPC4Q13310 UBL7-207ENST00000565494 458 ntTSL 213.96□□□□□ -0.176e-17■■■■■ 27.2
PABPC4Q13310 UBL7-208ENST00000566365 661 ntTSL 313.89□□□□□ -0.196e-17■■■■■ 27.2
PABPC4Q13310 UBL7-204ENST00000564488 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.296e-17■■■■■ 27.2
PABPC4Q13310 DOCK2-201ENST00000256935 6097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.384e-6■■■■■ 27.2
PABPC4Q13310 DOCK2-214ENST00000523351 3777 ntTSL 510.45□□□□□ -0.744e-6■■■■■ 27.2
PABPC4Q13310 DOCK2-207ENST00000519868 4361 ntTSL 210.4□□□□□ -0.754e-6■■■■■ 27.2
PABPC4Q13310 DOCK2-209ENST00000520450 2774 ntTSL 29.58□□□□□ -0.884e-6■■■■■ 27.2
PABPC4Q13310 DOCK2-211ENST00000520908 4654 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.074e-6■■■■■ 27.2
PABPC4Q13310 RPL21-202ENST00000311549 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.344e-22■■■■■ 27.2
PABPC4Q13310 RPL21-205ENST00000461690 681 ntTSL 55.75□□□□□ -1.494e-22■■■■■ 27.2
PABPC4Q13310 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.197e-16■■■■■ 27.2
PABPC4Q13310 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.037e-16■■■■■ 27.2
PABPC4Q13310 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.937e-16■■■■■ 27.2
PABPC4Q13310 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.551e-7■■■■■ 27.2
PABPC4Q13310 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.281e-7■■■■■ 27.2
PABPC4Q13310 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.261e-7■■■■■ 27.2
PABPC4Q13310 RALGDS-213ENST00000493438 4602 ntTSL 216.32■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 27.2
PABPC4Q13310 RALGDS-211ENST00000482648 5596 ntTSL 216.07■□□□□ 0.161e-7■■■■■ 27.2
PABPC4Q13310 RALGDS-208ENST00000469972 5817 ntTSL 1 (best)15.79■□□□□ 0.121e-7■■■■■ 27.2
PABPC4Q13310 RALGDS-203ENST00000372062 3596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 27.2
PABPC4Q13310 RALGDS-204ENST00000393157 3689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.681e-7■■■■■ 27.2
PABPC4Q13310 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.857e-13■■■■■ 27.1
PABPC4Q13310 EIF3I-202ENST00000373586 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.164e-44■■■■■ 27.1
PABPC4Q13310 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.182e-7■■■■■ 27.1
PABPC4Q13310 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.152e-7■■■■■ 27.1
PABPC4Q13310 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.142e-7■■■■■ 27.1
PABPC4Q13310 RPL27A-205ENST00000529227 607 ntTSL 1 (best)20.89■□□□□ 0.931e-323■■■■■ 27.1
PABPC4Q13310 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.371e-29■■■■■ 27.1
PABPC4Q13310 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.572e-7■■■■■ 27.1
PABPC4Q13310 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.715e-22■■■■■ 27
PABPC4Q13310 RPL21-201ENST00000272274 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.445e-22■■■■■ 27
PABPC4Q13310 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.559e-8■■■■■ 27
PABPC4Q13310 C7orf50-207ENST00000488073 853 ntTSL 521.92■■□□□ 1.19e-9■■■■■ 27
PABPC4Q13310 C7orf50-205ENST00000444428 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 318.55■□□□□ 0.569e-9■■■■■ 27
PABPC4Q13310 CCNB1-205ENST00000507798 767 ntTSL 35.14□□□□□ -1.592e-9■■■■■ 27
PABPC4Q13310 SENP3-203ENST00000580231 901 ntTSL 310□□□□□ -0.811e-47■■■■■ 27
PABPC4Q13310 SENP3-207ENST00000582789 536 ntTSL 27.39□□□□□ -1.231e-47■■■■■ 27
PABPC4Q13310 CUTA-207ENST00000479249 562 ntTSL 39.99□□□□□ -0.812e-12■■■■■ 27
PABPC4Q13310 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.952e-6■■■■■ 27
PABPC4Q13310 UTP18-206ENST00000583205 664 ntTSL 37.47□□□□□ -1.212e-6■■■■■ 27
PABPC4Q13310 UTP18-204ENST00000582150 897 ntTSL 1 (best)6.9□□□□□ -1.32e-6■■■■■ 27
PABPC4Q13310 UTP18-205ENST00000582832 464 ntTSL 36.3□□□□□ -1.42e-6■■■■■ 27
PABPC4Q13310 UTP18-203ENST00000579261 567 ntTSL 55.97□□□□□ -1.452e-6■■■■■ 27
PABPC4Q13310 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.797e-8■■■■■ 27
PABPC4Q13310 SPG21-213ENST00000561078 1520 ntTSL 517.67■□□□□ 0.427e-8■■■■■ 27
PABPC4Q13310 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.357e-8■■■■■ 27
PABPC4Q13310 SPG21-209ENST00000559199 2059 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.557e-8■■■■■ 27
PABPC4Q13310 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.911e-6■■■■■ 27
PABPC4Q13310 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.552e-78■■■■■ 27
PABPC4Q13310 TMEM141-202ENST00000465017 839 ntTSL 218.31■□□□□ 0.521e-6■■■■■ 27
PABPC4Q13310 TMEM141-204ENST00000483187 683 ntTSL 218.31■□□□□ 0.521e-6■■■■■ 27
PABPC4Q13310 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.441e-6■■■■■ 27
Retrieved 100 of 23,669 protein–RNA pairs in 179.6 ms