Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR1H3Q13133 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
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