Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF1Q13077 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
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TRAF1Q13077 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
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TRAF1Q13077 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
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TRAF1Q13077 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
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TRAF1Q13077 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
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TRAF1Q13077 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
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TRAF1Q13077 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF1Q13077 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
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