Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PRDM2Q13029 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PRDM2Q13029 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PRDM2Q13029 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PRDM2Q13029 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PRDM2Q13029 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PRDM2Q13029 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PRDM2Q13029 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PRDM2Q13029 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PRDM2Q13029 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC36.57■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
PRDM2Q13029 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC36.57■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
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