Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXC1Q12948 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXC1Q12948 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXC1Q12948 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXC1Q12948 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXC1Q12948 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXC1Q12948 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXC1Q12948 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXC1Q12948 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXC1Q12948 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXC1Q12948 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXC1Q12948 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXC1Q12948 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXC1Q12948 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXC1Q12948 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXC1Q12948 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXC1Q12948 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXC1Q12948 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXC1Q12948 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXC1Q12948 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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