Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC37.95■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC37.93■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC37.93■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
HMGXB3Q12766 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
HMGXB3Q12766 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
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