Protein–RNA interactions for Protein: Q12342

LDB17, Protein LDB17, yeastyeast

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB17Q12342 CET1YPL228W 1650 nt3.13□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 ROM1YGR070W 3468 nt3.13□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 STE24YJR117W 1362 nt3.12□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 HUL5YGL141W 2733 nt3.12□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 PIB1YDR313C 861 nt3.12□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt3.12□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt3.12□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 LRS4YDR439W 1044 nt3.12□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 YER165C-AYER165C-A 357 nt3.12□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 EMC2YJR088C 879 nt3.12□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 ERG2YMR202W 669 nt3.12□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 HHF2YNL030W 312 nt3.12□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 SUT2YPR009W 807 nt3.12□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 YBR292CYBR292C 372 nt3.12□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 UBP5YER144C 2418 nt3.12□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 ITT1YML068W 1395 nt3.12□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 FAR1YJL157C 2493 nt3.11□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 YDR535CYDR535C 501 nt3.11□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 GPP2YER062C 753 nt3.11□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 EPT1YHR123W 1176 nt3.11□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 YHR180WYHR180W 492 nt3.11□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt3.11□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 YIL175WYIL175W 318 nt3.11□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt3.11□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 HYM1YKL189W 1200 nt3.11□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 RPC37YKR025W 849 nt3.11□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 RPF2YKR081C 1035 nt3.11□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 PML39YML107C 1005 nt3.11□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 RPL19BYBL027W 570 nt3.11□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 YOR114WYOR114W 885 nt3.11□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 PIN3YPR154W 648 nt3.11□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 MAL12YGR292W 1755 nt3.1□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 MAL32YBR299W 1755 nt3.1□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 VPS3YDR495C 3036 nt3.1□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 YDR193WYDR193W 399 nt3.1□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 IZH1YDR492W 951 nt3.1□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt3.1□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 DCG1YIR030C 735 nt3.1□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 COS1YNL336W 1146 nt3.1□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 snR11snR11 258 nt3.1□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 CHS2YBR038W 2892 nt3.1□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 YTA7YGR270W 4140 nt3.09□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 EPL1YFL024C 2499 nt3.09□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 GIC2YDR309C 1152 nt3.09□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 PRP18YGR006W 756 nt3.09□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 PTI1YGR156W 1278 nt3.09□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt3.09□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 DOG1YHR044C 741 nt3.09□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 YKR011CYKR011C 1062 nt3.09□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt3.09□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 ILV5YLR355C 1188 nt3.09□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 ERV41YML067C 1059 nt3.09□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt3.09□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 YPR078CYPR078C 1119 nt3.09□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 ARA1YBR149W 1035 nt3.09□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 FAA2YER015W 2235 nt3.09□□□□□ -1.91
LDB17Q12342 RPA190YOR341W 4995 nt3.09□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 ECM18YDR125C 1362 nt3.09□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 NUF2YOL069W 1356 nt3.09□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 YDL180WYDL180W 1644 nt3.08□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 TIF4631YGR162W 2859 nt3.08□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt3.08□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 SCM4YGR049W 564 nt3.08□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 YBL062WYBL062W 381 nt3.08□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 SSN8YNL025C 972 nt3.08□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 YOL162WYOL162W 648 nt3.08□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 YPL035CYPL035C 348 nt3.08□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt3.08□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt3.08□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 YML096WYML096W 1578 nt3.08□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 MON1YGL124C 1935 nt3.07□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 GIS4YML006C 2325 nt3.07□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 NHP10YDL002C 612 nt3.07□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 BUD26YDR241W 288 nt3.07□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 RMT2YDR465C 1239 nt3.07□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 AIM23YJL131C 1071 nt3.07□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 YJR128WYJR128W 360 nt3.07□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 ARC19YKL013C 516 nt3.07□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 YNL184CYNL184C 327 nt3.07□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 PHO88YBR106W 567 nt3.07□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 CHO2YGR157W 2610 nt3.07□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 RGC1YPR115W 3252 nt3.07□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 SPO71YDR104C 3738 nt3.07□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 TOM70YNL121C 1854 nt3.07□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 HFM1YGL251C 3564 nt3.06□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 TAF2YCR042C 4224 nt3.06□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 PLP1YDR183W 693 nt3.06□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 YAT2YER024W 2772 nt3.06□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 SPT15YER148W 723 nt3.06□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 SNX4YJL036W 1272 nt3.06□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 PHD1YKL043W 1101 nt3.06□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 AHP1YLR109W 531 nt3.06□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 FLO1YAR050W 4614 nt3.06□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 YLR290CYLR290C 834 nt3.06□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 YBL065WYBL065W 345 nt3.06□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 JJJ1YNL227C 1773 nt3.06□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 RIF1YBR275C 5751 nt3.06□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 DYN1YKR054C 12279 nt3.06□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 VAS1YGR094W 3315 nt3.06□□□□□ -1.92
LDB17Q12342 DUF1YOL087C 3351 nt3.05□□□□□ -1.92
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